Prasat Baan Panna byggdes på 1700-talet enligt buddhistisk tideräkning enligt kung Jayavarman VII:s kungliga ambitioner att fungera som en "Arokayasala", eller ett lokalt sjukhus, längs den antika vägen. Detta drevs av Mahayana-buddistiska övertygelser som fokuserade på att lindra lidande och sjukdom för människor i olika städer i det antika Khmerriket.