Flygdäcket på HTMS Chakri Naruebet är ett viktigt operationsområde som är utformat för att stödja säker start och landning av marinflygplan. Det kan ta emot helikoptrar och flygplan med kort start- och landningssträcka, med tydligt markerade flygstandarder och omfattande säkerhetssystem. Utöver militära operationer används flygdäcket också för humanitärt bistånd och katastrofhjälpsuppdrag, vilket återspeglar den kungliga thailändska flottans internationella kapacitet.